Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SKIDA1Q1XH10 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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