Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSPP1Q1MSJ5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSPP1Q1MSJ5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms