Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC142Q17RM4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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