Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IMPG1Q17R60 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IMPG1Q17R60 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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