Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME3Q16798 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME3Q16798 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME3Q16798 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME3Q16798 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ME3Q16798 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME3Q16798 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME3Q16798 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME3Q16798 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME3Q16798 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME3Q16798 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME3Q16798 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ME3Q16798 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME3Q16798 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME3Q16798 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME3Q16798 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME3Q16798 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME3Q16798 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME3Q16798 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME3Q16798 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME3Q16798 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME3Q16798 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME3Q16798 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME3Q16798 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ME3Q16798 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ME3Q16798 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ME3Q16798 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ME3Q16798 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ME3Q16798 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME3Q16798 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME3Q16798 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME3Q16798 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME3Q16798 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME3Q16798 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME3Q16798 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME3Q16798 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ME3Q16798 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME3Q16798 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME3Q16798 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME3Q16798 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME3Q16798 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME3Q16798 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME3Q16798 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME3Q16798 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME3Q16798 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME3Q16798 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME3Q16798 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ME3Q16798 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ME3Q16798 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME3Q16798 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME3Q16798 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME3Q16798 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ME3Q16798 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ME3Q16798 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME3Q16798 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME3Q16798 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME3Q16798 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME3Q16798 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME3Q16798 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME3Q16798 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ME3Q16798 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME3Q16798 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME3Q16798 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME3Q16798 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME3Q16798 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME3Q16798 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME3Q16798 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ME3Q16798 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME3Q16798 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME3Q16798 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME3Q16798 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME3Q16798 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME3Q16798 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME3Q16798 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME3Q16798 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME3Q16798 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME3Q16798 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms