Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CA9Q16790 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CA9Q16790 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CA9Q16790 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CA9Q16790 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CA9Q16790 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CA9Q16790 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CA9Q16790 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CA9Q16790 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CA9Q16790 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CA9Q16790 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CA9Q16790 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CA9Q16790 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CA9Q16790 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CA9Q16790 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CA9Q16790 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CA9Q16790 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CA9Q16790 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CA9Q16790 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CA9Q16790 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CA9Q16790 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CA9Q16790 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CA9Q16790 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CA9Q16790 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CA9Q16790 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CA9Q16790 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CA9Q16790 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CA9Q16790 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CA9Q16790 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CA9Q16790 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CA9Q16790 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CA9Q16790 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CA9Q16790 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CA9Q16790 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CA9Q16790 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CA9Q16790 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CA9Q16790 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CA9Q16790 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CA9Q16790 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CA9Q16790 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CA9Q16790 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CA9Q16790 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms