Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHRNA6Q15825 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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