Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPTX1Q15818 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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