Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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