Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TAF1CQ15572 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TAF1CQ15572 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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