Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDGFRLQ15198 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDGFRLQ15198 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms