Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDK3Q15120 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms