Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCAPHQ15003 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCAPHQ15003 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NCAPHQ15003 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCAPHQ15003 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NCAPHQ15003 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NCAPHQ15003 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NCAPHQ15003 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NCAPHQ15003 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NCAPHQ15003 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NCAPHQ15003 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NCAPHQ15003 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCAPHQ15003 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCAPHQ15003 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NCAPHQ15003 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NCAPHQ15003 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NCAPHQ15003 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms