Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMCO1Q147U7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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