Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERV3-1Q14264 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERV3-1Q14264 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERV3-1Q14264 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERV3-1Q14264 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERV3-1Q14264 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERV3-1Q14264 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERV3-1Q14264 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERV3-1Q14264 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERV3-1Q14264 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERV3-1Q14264 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERV3-1Q14264 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERV3-1Q14264 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERV3-1Q14264 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERV3-1Q14264 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERV3-1Q14264 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERV3-1Q14264 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERV3-1Q14264 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERV3-1Q14264 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERV3-1Q14264 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERV3-1Q14264 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERV3-1Q14264 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERV3-1Q14264 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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