Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CKAP5Q14008 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
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