Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDE6HQ13956 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PDE6HQ13956 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PDE6HQ13956 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PDE6HQ13956 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PDE6HQ13956 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PDE6HQ13956 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDE6HQ13956 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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