Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EXOSC2Q13868 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EXOSC2Q13868 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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