Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNX3Q13761 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNX3Q13761 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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