Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBA3CQ13748 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TUBA3CQ13748 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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