Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL1Q13616 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
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