Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PKD2Q13563 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKD2Q13563 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms