Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF4BQ13523 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.32■■□□□ 1
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PRPF4BQ13523 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
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PRPF4BQ13523 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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PRPF4BQ13523 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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PRPF4BQ13523 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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PRPF4BQ13523 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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PRPF4BQ13523 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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PRPF4BQ13523 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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PRPF4BQ13523 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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PRPF4BQ13523 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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PRPF4BQ13523 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
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PRPF4BQ13523 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF4BQ13523 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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