Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE3BQ13370 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE3BQ13370 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
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