Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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ITGB3BPQ13352 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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ITGB3BPQ13352 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGB3BPQ13352 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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ITGB3BPQ13352 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
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ITGB3BPQ13352 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGB3BPQ13352 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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