Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RIGQ13278 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RIGQ13278 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIGQ13278 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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