Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPPAQ13219 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PAPPAQ13219 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PAPPAQ13219 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PAPPAQ13219 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PAPPAQ13219 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PAPPAQ13219 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PAPPAQ13219 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPPAQ13219 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPPAQ13219 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPPAQ13219 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPPAQ13219 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPPAQ13219 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPPAQ13219 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPPAQ13219 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPPAQ13219 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPPAQ13219 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPPAQ13219 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPPAQ13219 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPPAQ13219 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms