Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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ERCC8Q13216 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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ERCC8Q13216 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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ERCC8Q13216 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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ERCC8Q13216 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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ERCC8Q13216 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERCC8Q13216 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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