Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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NR1H3Q13133 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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NR1H3Q13133 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1H3Q13133 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NR1H3Q13133 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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