Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RESTQ13127 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RESTQ13127 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RESTQ13127 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RESTQ13127 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RESTQ13127 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RESTQ13127 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RESTQ13127 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RESTQ13127 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RESTQ13127 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RESTQ13127 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RESTQ13127 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RESTQ13127 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RESTQ13127 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RESTQ13127 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RESTQ13127 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RESTQ13127 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RESTQ13127 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RESTQ13127 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RESTQ13127 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RESTQ13127 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RESTQ13127 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RESTQ13127 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RESTQ13127 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RESTQ13127 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RESTQ13127 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RESTQ13127 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RESTQ13127 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RESTQ13127 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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RESTQ13127 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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RESTQ13127 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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RESTQ13127 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RESTQ13127 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RESTQ13127 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RESTQ13127 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RESTQ13127 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RESTQ13127 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RESTQ13127 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RESTQ13127 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RESTQ13127 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RESTQ13127 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RESTQ13127 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RESTQ13127 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RESTQ13127 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RESTQ13127 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RESTQ13127 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RESTQ13127 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RESTQ13127 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RESTQ13127 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RESTQ13127 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RESTQ13127 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms