Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHAF1AQ13111 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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