Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPS1Q13098 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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