Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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NFX1Q12986 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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NFX1Q12986 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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NFX1Q12986 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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NFX1Q12986 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NFX1Q12986 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms