Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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TRAF2Q12933 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAF2Q12933 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
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TRAF2Q12933 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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TRAF2Q12933 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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TRAF2Q12933 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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TRAF2Q12933 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAF2Q12933 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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