Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SREBF2Q12772 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SREBF2Q12772 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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