Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBRQ0VD83 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms