Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NIPAL4Q0D2K0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms