Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
IFFO1Q0D2I5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IFFO1Q0D2I5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms