Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CD47Q08722 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CD47Q08722 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD47Q08722 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD47Q08722 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD47Q08722 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms