Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms