Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FMODQ06828 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FMODQ06828 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FMODQ06828 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms