Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LTBQ06643 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LTBQ06643 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LTBQ06643 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms