Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RUNX1T1Q06455 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RUNX1T1Q06455 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms