Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNG1Q06432 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms