Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPN12Q05209 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPN12Q05209 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms