Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PLOD1Q02809 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms