Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TNFRSF17Q02223 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF17Q02223 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms