Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC6A3Q01959 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms