Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms