Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244.2 ms